Untuk mewujudkan Visi & Misi Rumah Dhu'afa menyelenggarakan program sebagai berikut :
- Menyelenggarakan pendidikan untuk tingkat SD dan SMP berbasis Islamic Home Schooling yang bernama Sekolah Al-Qur'an dan Informatika
- Menyelenggarakan Pesantren Tahfidz untuk tinggat Mahasiswa
- Menyelenggarakan Bakti Sosial dan Pengobatan Gratis bagi yang tidak mampu
- Menjadi Lembaga Penyalur Zakat yang Adil dan Terpercaya
- Mendirikan Pusat Pendidikan dan Pelatihan